Der fünfmalige Majorchampion aus Nordirland knüpfte auf dem schnellen Grün in Augusta umgehend an die 67er-Runde an, die ihm am Vortag die geteilte Führung mit Sam Burns (USA) beschert hatte. An den Löchern 2, 3 und 4 gelang McIlroy jeweils ein Birdie, danach unterlief ihm allerdings ein Bogey. Die Back Nine begann der Nordire dann mit einem Bogey, bügelte dieses aber mit Birdies auf den Löchern 12 und 13 aus.
McIlroy und Burns waren als Führungsduo mit -5 auf die zweite Runde gegangen. Der US-Amerikaner beendete den zweiten Tag mit einer 71 und stand damit insgesamt bei -6.
Mitfavorit Justin Rose spielte auf dem Par-72-Kurs am Freitag eine 69, nach 36 gespielten Löchern lag der Vorjahreszweite mit fünf Schlägen unter Par in Lauerstellung. Sein englischer Landsmann Tyrrell Hatton, der noch kein Majorturnier gewonnen hat, rückte dank einer 66 in die Spitzengruppe (-4).
Der Weltranglistenerste Scottie Scheffler leistete sich dagegen vier Bogeys und gab in einer schwachen 74er-Runde womöglich frühzeitig alle Chancen auf seinen dritten Masterssieg aus der Hand. Einige andere große Namen kämpften am Freitag darum, den Cut der besten 50 Spieler zu schaffen, darunter der zweimalige Majorsieger Jon Rahm (Spanien) oder US-Star Bryson DeChambeau.